Λογισμικό

Λογισμικό Ανάλυσης Εικόνας

LAS AF: Λογισμικό συνεστιακής απεικόνισης της Leica Microsystems - Για λήψη και ανάλυση δεδομένων συνεστιακής μικροσκοπίας.

LAS AS: Λογισμικό χειρισμού έγχρωμων καμερών της Leica Microsystems  για λήψη εικόνων

IMARIS: Μια πολύ ισχυρή αυτόνομη εφαρμογή για επεξεργασία και ανάλυση εικόνας από την Bitplane. Ενσωματώνεται εύκολα σε υπάρχουσες ροές εργασίας επεξεργασίας εικόνας και μπορεί να χρησιμοποιήσει υπάρχουσες μακροεντολές Matlab και ImageJ. Όλα τα υποσυστήματα του IMARIS (3D Vis, Filament, Measurement, Vantage, Tracking) είναι διαθέσιμα σε 3 σταθμούς εργασίας της μονάδας.

VOLOCITY: Ένα πλήρες σύστημα απεικόνισης για την έρευνα στις επιστήμες ζωής από την Perkin Elmer. Τέσσερις ενσωματωμένες αλλά ξεχωριστές μονάδες παρέχουν μια πλήρη σειρά εργαλείων για αποκατάσταση τρισδιάστατης εικόνας, οπτικοποίηση, μέτρηση, παρακολούθηση και χαρτογράφηση.

HUYGENS: Λογισμικό για την ανακατασκευή εικόνας.  Εστιάζει στην αποσυνέλιξη εικονας (deconvolution) αλλά δίνει και την δυνατότητα προ-επεξεργασίας για την βελτίωσης πολλών προβλημάτων που μπορεί να εμπεριέχονται σε εικόνες μικροσκοπίας όπως χρωματικά λάθη, φωτοεξασθένιση, κίνηση.  Εχει διαφορετικούς αλγορίθμους για ποικιλία διαφορετικών μικροσκοπίων και απεικονιστικών μεθόδων όπως εικόνες ευρέως πεδίου (widefield images), εικόνες πολλαπλών χρωμάτων και πολλαπλών φωτονίων (Multi Channel - Μulti-Photon), περιστρεφόμενου δίσκου (spinning-disk),  συνεστιακού (confocal), Array Detector, υπερδιακριτικότητας (STED) και μικροσκοπίας επίπεδου φωτός (light-sheet) images.

HCImageLive και HCImage DIA: HCImage Dynamic Intensity Analysis (DIA) για επεξεργασία υψηλής ταχύτητας και ανάλυση έντασης με την πάροδο του χρόνου. Για την αυτοματοποίηση των καμερών Hamamatsu και των μικροσκοπίων Leica DMR.

IMAGEJ/FIJI: Το πρότυπο ανοιχτού κωδικα λογισμικό για την ποσοτική ανάλυση εικόνων μικροσκοπίας.  Με plugins   για την εφαρμογή σύνθετων τεχνικών ανάλυσης αλλά και γλώσσα macro  για την αυτοματοποίηση του προτοκόλου του χρήστη.

MATLAB: Μια γλώσσα προγραμματισμού υψηλού επιπέδου και ένα διαδραστικό τεχνικό υπολογιστικό περιβάλλον που παρέχει λειτουργίες για ανάπτυξη αλγορίθμων, ανάλυση και οπτικοποίηση δεδομένων καθώς και αριθμητικούς υπολογισμούς.