Biomedical Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών, Ακαδημίας ΑθηνώνΑκαδημία Αθηνών
Επιστημονικό Προσωπικό

Ιωάννης Ιωάννης Μιχαλόπουλος, PhD
Ειδικός Λειτουργικός Επιστήμονας Β'

Τηλέφωνο : +30 210 6597 127
Fax : +30 210 6597 545
e-mail : imichalop@bioacademy.gr


Κέντρο :

Βιολογίας Συστημάτων

Ιστοσελίδα Εργαστηρίου :

Εργαστήριο Μιχαλόπουλου


Σύντομο Βιογραφικό

Ο Ιωάννης Μιχαλόπουλος έλαβε το πτυχίο του στη Βιολογία από το Πανεπιστήμιο Αθηνών και το διδακτορικό του στη Μοριακή Βιολογία από το Πανεπιστήμιο του St Andrews. Το 2001, μεταπήδησε στη Βιοπληροφορική, κάνοντας μεταδιδακτορική έρευνα στο Πανεπιστήμιο του Leeds (2001-2005) και στο Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών της Ακαδημίας Αθηνών (2006-2008). Από το 2008, ο Ιωάννης Μιχαλόπουλος εργάζεται ως Ειδικός Λειτουργικός Επιστήμων Β’ του Τμήματος Κρυοβιολογίας των Αρχέγονων Κυττάρων του Κέντρου Ανοσολογίας και Μεταμοσχεύσεων στο Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών της Ακαδημίας Αθηνών. Είναι υπεύθυνος για το σχεδιασμό και τη διατήρηση διαφόρων βιοτραπεζικών δικτυακών τόπων (Ελληνική Τράπεζα Ομφαλοπλακουντιακού Αίματος, Υποδομές Βιοτραπεζικών και Βιομοριακών Ερευνητικών Πόρων−BBMRI-GR, Ελληνική Βιοτράπεζα Νόσου του Πάρκινσον, κλπ). Οι ερευνητικές του δραστηριότητες συμπεριλαμβάνουν πολλές συνεργασίες με πειραματικούς ερευνητές και επιστήμονες πληροφορικής, στο πεδίο της Γενωμικής, Μεταγραφωμικής, Επιγενωμικής, Πρωτεωμικής, κλπ. Ο Ιωάννης Μιχαλόπουλος είναι ιδρυτικό μέλος της Ελληνικής Εταιρείας Υπολογιστικής Βιολογίας και Βιοπληροφορικής. Ανήκει στο Διδακτικό Προσωπικό του ΜΔΕ Βιοπληροφορικής του Τμήματος Βιολογίας του Πανεπιστημίου Αθηνών, διδάσκοντας τμήματα των μαθημάτων "Μοριακή Αναγνώριση" και "Μικροσυστοιχίες". Είναι κριτής των Nucleic Acid Research, Bioinformatics και PLoS One.

Επιλεγμένες Δημοσιεύσεις

Giannopoulos, N.G., Michalopoulos, I., Papandreou, N.C., Malatras, A., Iconomidou, V.A., and Hamodrakas, S.J. (2012) LepChorionDB, a database of Lepidopteran chorion proteins and a set of tools useful for the identification of chorion proteins in Lepidopteran proteomes. Insect Biochem Mol Biol, doi:10.1016/j.ibmb.2012.12.001

Logotheti, S., Papaevangeliou, D., Michalopoulos, I., Sideridou, M., Tsimaratou, K., Christodoulou, I., Pyrillou, K., Gorgoulis, V., Vlahopoulos, S., and Zoumpourlis, V. (2012). Progression of mouse skin carcinogenesis is associated with increased ERα levels and is repressed by a dominant negative form of ERα. PLoS One 7, e41957.

Michalopoulos, I., Pavlopoulos, G.A., Malatras, A., Karelas, A., Kostadima, M.A., Schneider, R., and Kossida, S. (2012). Human gene correlation analysis (HGCA): A tool for the identification of transcriptionally coexpressed genes. BMC Res Notes 5, 265.

Pavlopoulou, A., and Michalopoulos, I. (2011). State-of-the-art bioinformatics protein structure prediction tools (Review). Int J Mol Med 28, 295-310.

Pavlopoulou, A., Pampalakis, G., Michalopoulos, I., and Sotiropoulou, G. (2010). Evolutionary history of tissue kallikreins. PLoS One 5, e13781.

Logotheti, S., Michalopoulos, I., Sideridou, M., Daskalos, A., Kossida, S., Spandidos, D.A., Field, J.K., Vojtesek, B., Liloglou, T., Gorgoulis, V., Zoumpourlis, V. (2010). Sp1 binds to the external promoter of the p73 gene and induces the expression of TAp73γ in lung cancer. The FEBS J 277,  3014-3027.

Roubelakis, M.G., Zotos, P., Papachristoudis, G., Michalopoulos, I., Pappa, K.I., Anagnou, N.P., and Kossida, S. (2009). Human microRNA target analysis and gene ontology clustering by GOmir, a novel stand-alone application. BMC Bioinformatics 10 Suppl 6, S20.

Manfield, I.W., Jen, C.H., Pinney, J.W., Michalopoulos, I., Bradford, J.R., Gilmartin, P.M., and Westhead, D.R. (2006). Arabidopsis Co-expression Tool (ACT): web server tools for microarray-based gene expression analysis. Nucleic Acids Res 34, W504-509.

Jen, C.H., Manfield, I.W., Michalopoulos, I., Pinney, J.W., Willats, W.G., Gilmartin, P.M., and Westhead, D.R. (2006). The Arabidopsis co-expression tool (ACT): a WWW-based tool and database for microarray-based gene expression analysis. Plant J 46, 336-348.

Jen, C.H., Michalopoulos, I., Westhead, D.R., and Meyer, P. (2005). Natural antisense transcripts with coding capacity in Arabidopsis may have a regulatory role that is not linked to double-stranded RNA degradation. Genome Biol 6, R51.

Torrance, G.M., Gilbert, D.R., Michalopoulos, I., and Westhead, D.W. (2005). Protein structure topological comparison, discovery and matching service. Bioinformatics 21, 2537-2538.

Michalopoulos, I., Torrance, G.M., Gilbert, D.R., and Westhead, D.R. (2004). TOPS: an enhanced database of protein structural topology. Nucleic Acids Res 32, D251-254.

PubMed:

PubMed Link