Biomedical Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών, Ακαδημίας ΑθηνώνΑκαδημία Αθηνών
Επιστημονικό Προσωπικό

Σταμάτης Ν. Σταμάτης Ν. Παγκάκης, PhD
Ειδικός Λειτουργικός Επιστήμονας Α'

Τηλέφωνο : +30 210 6597 093
Fax : +30 210 6597 545
e-mail : spagakis@bioacademy.gr


Κέντρο :

Βασική Έρευνα

Ιστοσελίδα Μονάδας Υποστήριξης Έρευνας :

Βιοαπεικόνιση


Σύντομο Βιογραφικό

Επικεφαλής της Μονάδας Απεικονιστικής Μικροσκοπίας του Ιδρύματος Ιατροβιολογικών Ερευνών της Ακαδημίας Αθηνών  (ΙΙΒΕΑΑ).

Απεκτησε το δίπλωμα το Ηλεκτρολόγου Mηχανικού από το Πενεπιστήμιο Πατρών και  τα MSc και Ph.D. στην Βιοιατρική Μηχανική απο το Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνια στο Davis (ΗΠΑ).  Εχει εργαστεί για πάνω απο 30 χρόνια  στο πεδίο της οπτικής μικροσκοπίας και έχει μακρόχρονη πείρα στη συνεστιακή μικροσκοπία, σε τεχνικές παρακολούθησης (FRAP, FRET, FLIM)  καθώς στις τεχνικές επεξεργασίας και ανάλυσης ψηφιακής εικόνας βιολογικού περιεχομένου.

Ο Κος Παγκάκης διετέλεσε ερευνητής στο εργαστήριο φυσιολογίας του Πανεπιστημίου της Οξφόρδης (1994-1997) και μετέπειτα διευθυντής της μονάδας Μικροσκοπίας και ανάλυσης εικόνας στο Εθνικό Ίδρυμα ιατρικής Έρευνας (MRC-NIMR) της μεγάλης Βρετανίας. Το 2004 ανέλαβε τη δημιουργία της πρότυπης μονάδας απεικονιστικής μικροσκοπίας στο ΙΙΒΕΑΑ, θέση την οποία κατέχει μέχρι σήμερα.  

Η έρευνά του έχει χρηματοδοτηθεί από διεθνείς οργανισμούς όπως η Wellcome Trust και  το Medical Research Council (MRC) της Μεγάλης Βρετανίας καθώς και την Ευρωπαική ένωση, για την οποία διετέτεσε διευθυντής ερευνητικής ομάδας σε πρόγραμμα ευρωπαικού δικτύου.
 
Έχει πάνω από 30 δημοσιεύσεις σε κρινόμενα διεθνή περιοδικά και συνέδρια.  Το ερευνητικό του ενδιαφέρον σήμερα επικεντρώνεται στην δημιουργία καινούριων τεχνικών μικροσκοπίας, και αλγορίθμων και λογισμικού επεξεργασίας και ανάλυσης εικόνας βιολογικού περιεχομένου

Είναι μέλος των IEEE, Society for Engineering in Medicine and Biology (EMBS), the Royal Microscopical Society (RMS) and the Microcirculatory Society (MCS).

Επιλεγμένες Δημοσιεύσεις

2021 Pantazopoulou V., Delis A.D., Georgiou S., Pagakis S.N., Dragona E., Kloukina I., Chatzitheodoridis E., Trebicka J., Velentzas A. D., Thiele M., Gagos S., Thanos D., Tseleni S., Stravopodis D.J., Anasasiadou E.: AGO2 localizes to cytokinetic protrusions in a p38-dependent manner and is needed for accurate cell division. Commun Biol. 2021 Jun 11;4(1):726.

2021   Stergiou I.E., Kambas K., Poulaki A.,Giannouli S., Katsila T., Dimitrakopoulou A., Vidali V., Mouchtouris V., Kloukina I., Xingi E., Pagakis S.N., Probert L., Patrinow G.P., Ritis K., Tzioufas A.G., and Voulgarelis M.: Exploiting the Role of Hypoxia-Inducible Factor 1 and Pseudohypoxia in the Myelodysplastic Syndrome Pathophysiology. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(8), 4099. Commun Biol.

2020  Daskalakis K., Alexandraki K.I., Kloukina I., Kassi E., Felekouras E., Xingi E., Pagakis S.N., Tsolakis A.V., Andreakos E., Kaltsas G., Kambas K.: Increased autophagy/mitophagy levels in primary tumours of patients with pancreatic neuroendocrine neoplasms. Endocrine 2020 Feb29.

2013    F. Karagianni; G. Kaltsa; N. Prakoura; P. Politis; V. Kaltezioti; S. Psarras; S. Pagakis; M. Katsimboulas; C. Chatziantoniou; A. S. Charonis, Transgelin up-regulation in Obstructive Nephropathy, PLOS ONE, June 2013.

2010  E.L. Papadopoulou, A. Samara, M. Barberoglou, A. Manousaki, S.N. Pagakis, E. Anastasiadou, C. Fotakis and E. Stratakis: Silicon scaffolds promoting three-dimensional neuronal web of cytoplasmic processes. Tissue Engineering, Part C: Methods. Jun, 16(3):497-502.

2008    J. Adler, S.N. Pagakis and I. Parmryd: Replicate Based Noise Corrected Correlation for Accurate Measurements of Colocalization, J. Micrsc.,  230(1):121-133. IF1.56

2006    M. C. Coles, H. Veiga-Fernandes, K. E. Foster, T. Norton, S. N.Pagakis, B. Seddon and D. Kioussis:  Role of T, NK cells and IL7/IL7r interactions during neonatal maturation of lymph nodes  Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Sep 5;103(36):13457-62.

2003    Festenstein R., S.N. Pagakis, K. Hiragami, D. Lyon, A. Verrault, B. Sekali and D. Kioussis: Modulation of heterochromatin protein 1 dynamics in primary mammalian cells. Science, Jan 31, 299:719-721

2003    J. Adler J. and S.N. Pagakis: Reducing image distortions due to temperature related microscope stage drift. J. Microsc. 210(2):131-136.

2002    Daly C.J., McGee A., Vila E., Briones A., Arribas S.M., Pagakis S.N., Adler J., Merle A., Maddison J., Pedersen J., McGrath J.C.:  Analysing the 3D structure of blood vessels using confocal microscopy. Microscopy & Analysis, 92:5-8.

1999     Erent M., S.N. Pagakis, J.P. Browne and P. Bayley:  Association of calmodulin with cytoskeletal structures at different stages of HeLa cell division, visualized by a calmodulin-EGFP fusion protein, Mol. Cell Biol. Res. Com., 1:209-215.

1994    Pagakis S.N. and F.E. Curry:  Imaging of Ca2+ transients in endothelial cells of single perfused capillaries: correlation of peak [Ca2+]i with sites of macromolecule leakage. Microcirculation, 1(4):213-230.

PubMed:

PubMed Link