Επιστημονικό Προσωπικό

Σύντομο Βιογραφικό

Ο Γιάννης Βατσέλλας είναι ο εργαστηριακός υπεύθυνος του Ελληνικού Κέντρου Γονιδιωματικής του ΙΙΒΕΑΑ. Είναι μοριακός βιολόγος, πτυχιούχος του Τμήματος Βιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης και διδάκτωρ Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής από το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης. Ως προπτυχιακός φοιτητής πραγματοποίησε έρευνα πάνω στη γενετική του κουνουπιού της ελονοσίας, στο εργαστήριο ελέγχου παρασίτων & ασθενειών του Δρ. Χρήστου Λούη στο ΙΤΕ. Η διδακτορική του διατριβή πραγματοποιήθηκε στο εργαστήριο του Δρ. Δημήτρη Θάνου, αρχικά στο ΕΚΕΒΕ «ΑΛΕΞΑΝΔΡΟΣ ΦΛΕΜΙΓΚ» και κατόπιν στο ΙΙΒΕΑΑ, μελετώντας μηχανισμούς με τους οποίους τα ανθρώπινα γονίδια ανταποκρίνονται σε περιβαλλοντικά ερεθίσματα κατά την ανάπτυξη και την κυτταρική διαφοροποίηση. Ως μεταδιδακτορικός ερευνητής συνεργάστηκε με την Δρ. Γιασεμή Καπετανάκη στο ΙΙΒΕΑΑ, πάνω στη γενετική ανάλυση των καρδιαγγειακών παθήσεων με γονιδιακά πάνελ και αλληλούχιση νέας γενεάς (NGS). Το 2017 ανέλαβε τη διεύθυνση του Ελληνικού Κέντρου Γονιδιωματικής του ΙΙΒΕΑΑ. Πέραν της έρευνας πάνω στην εφαρμογή τεχνολογιών γονιδιωματικής στην κατανόηση των ανθρώπινων ασθενειών, έχει επίσης σχεδιάσει και πραγματοποιήσει πολυάριθμες αναλύσεις γονιδιωματικής, με πληθώρα διαφορετικών τεχνολογιών NGS, τόσο για ερευνητικούς όσο και για διαγνωστικούς σκοπούς, σε συνεργασία με ερευνητές και ιατρούς στην Ελλάδα και το εξωτερικό. Είναι μέλος διαφόρων Ελληνικών και Ευρωπαϊκών πρωτοβουλιών, όπως τα Ελληνικά Δίκτυα Ιατρικής Ακριβείας στην Ογκολογία, στις καρδιαγγειακές νόσους, στις Νευροεκφυλιστικές νόσους, το Ελληνικό Δίκτυο Γονιδιωματικής Επιτήρησης του SARS-CoV2, το Ευρωπαϊκό δίκτυο CORBEL κ.α. Υπό τη διεύθυνση του, το Ελληνικό Κέντρο Γονιδιωματικής έχει πραγματοποιήσει τη συντριπτική πλειοψηφία της γονιδιωματικής επιτήρησης του ιού SARS-CoV2 στην Ελλάδα, συμβάλλοντας σημαντικά στην κατανόηση και αντιμετώπιση της πανδημία του SARS-CoV2.

Education/Training

• Ph.D., Molecular biology and genetics, Aristotle University of Thessaloniki, Department of Molecular Biology and Genetics, 2011
• B.S., Biology, University of Crete, Department of Biology, 2004

Postdoctoral Positions

• Postdoctoral Fellow, Application of Genomics technologies in understanding human disease, BRFAA, Greek Genome Center, 2017-2023
• Postdoctoral Fellow, Genetics of Cardiovascular Disease, BRFAA, Center of Basic Research, Cell Biology lab, 2012-2017

Faculty Positions

• Research Scientist, Associate Professor level, BRFAA, Systems biology center, Greek Genome Center, 2023 –

Expertise/Research activities

• Genomics, transcriptomics, metagenomics, epigenomics
• molecular diagnostics, cancer, cardiovascular diseases,
• GWAS
• single-cell genomics

Επιλεγμένες Δημοσιεύσεις

Siatra P, Vatsellas G, Chatzianastasiou A, Balafas E, Manolakou T, Papapetropoulos A, Agapaki A, Mouchtouri ET, Ruchaya PJ, Korovesi AG, Mavroidis M, Thanos D, Beis D, Kokkinopoulos I. Return of the Tbx5; lineage-tracing reveals ventricular cardiomyocyte-like precursors in the injured adult mammalian heart. NPJ Regen Med. 2023 Mar 3;8(1):13. doi: 10.1038/s41536-023-00280-9. PMID: 36869039; PMCID: PMC9984483.

Bousali M, Pogka V, Vatsellas G, Loupis T, Athanasiadis EI, Zoi K, Thanos D, Paraskevis D, Mentis A, Karamitros T. Tracing the First Days of the SARS-CoV-2 Pandemic in Greece and the Role of the First Imported Group of Travelers. Microbiol Spectr. 2022 Dec 21;10(6):e0213422. doi: 10.1128/spectrum.02134-22. Epub 2022 Nov 21. PMID: 36409093; PMCID: PMC9769540.

Madè A, Greco S, Vausort M, Miliotis M, Schordan E, Baksi S, Zhang L, Baryshnikova E, Ranucci M, Cardani R, Fagherazzi G, Ollert M, Tastsoglou S, Vatsellas G, Hatzigeorgiou A, Firat H, Devaux Y, Martelli F. Association of miR-144 levels in the peripheral blood with COVID-19 severity and mortality. Sci Rep. 2022 Nov 21;12(1):20048. doi: 10.1038/s41598-022-23922-2. PMID: 36414650; PMCID: PMC9681736.

Laidou S, Grigoriadis D, Papanikolaou S, Foutadakis S, Ntoufa S, Tsagiopoulou M, Vatsellas G, Anagnostopoulos A, Kouvatsi A, Stavroyianni N, Psomopoulos F, Makris AM, Agelopoulos M, Thanos D, Chatzidimitriou A, Papakonstantinou N, Stamatopoulos K. The TΑp63/BCL2 axis represents a novel mechanism of clinical aggressiveness in chronic lymphocytic leukemia. Blood Adv. 2022 Apr 26;6(8):2646-2656. doi: 10.1182/bloodadvances.2021006348. PMID: 35235952; PMCID: PMC9043946.

Morianos I, Tsitsopoulou A, Potaris K, Valakos D, Fari O, Vatsellas G, Bostantzoglou C, Photiades A, Gaga M, Xanthou G, Semitekolou M. Activin-A impedes the establishment of CD4+ T cell exhaustion and enhances anti-tumor immunity in the lung. J Exp Clin Cancer Res. 2021 Sep 21;40(1):295. doi: 10.1186/s13046-021-02092-5. PMID: 34548096; PMCID: PMC8454162.

Roupakia E, Chavdoula E, Karpathiou G, Vatsellas G, Chatzopoulos D, Mela A, Gillette JM, Kriegsmann K, Kriegsmann M, Batistatou A, Goussia A, Marcu KB, Karteris E, Klinakis A, Kolettas E. Canonical NF-κB Promotes Lung Epithelial Cell Tumour Growth by Downregulating the Metastasis Suppressor CD82 and Enhancing Epithelial-to-Mesenchymal Cell Transition. Cancers (Basel). 2021 Aug 26;13(17):4302. doi: 10.3390/cancers13174302. PMID: 34503110; PMCID: PMC8428346.

Levante A, Lazzi C, Vatsellas G, Chatzopoulos D, Dionellis VS, Makrythanasis P, Neviani E, Folli C. Genome Sequencing of five Lacticaseibacillus Strains and Analysis of Type I and II Toxin-Antitoxin System Distribution. Microorganisms. 2021 Mar 21;9(3):648. doi: 10.3390/microorganisms9030648. PMID: 33800997; PMCID: PMC8003834.

Rocca MS, Vignoli A, Tenori L, Ghezzi M, De Rocco Ponce M, Vatsellas G, Thanos D, Padrini R, Foresta C, De Toni L. Evaluation of Serum/Urine Genomic and Metabolomic Profiles to Improve the Adherence to Sildenafil Therapy in Patients with Erectile Dysfunction. Front Pharmacol. 2020 Dec 10;11:602369. doi: 10.3389/fphar.2020.602369. PMID: 33536912; PMCID: PMC7849189.

Lavigne MD, Vatsellas G, Polyzos A, Mantouvalou E, Sianidis G, Maraziotis I, Agelopoulos M, Thanos D. Composite macroH2A/NRF-1 Nucleosomes Suppress Noise and Generate Robustness in Gene Expression. Cell Rep. 2015 May 19;11(7):1090-101. doi: 10.1016/j.celrep.2015.04.022. Epub 2015 May 7. PMID: 25959814.

Capetanaki Y, Papathanasiou S, Diokmetzidou A, Vatsellas G, Tsikitis M. Desmin related disease: a matter of cell survival failure. Curr Opin Cell Biol. 2015 Feb;32:113-20. doi: 10.1016/j.ceb.2015.01.004. Epub 2015 Feb 11. PMID: 25680090; PMCID: PMC4365784.

https://scholar.google.com/citations?hl=el&user=B7RyPbIAAAAJ

https://orcid.org/0000-0002-1631-1060

 

PubMed:

PubMed Link