Επιστημονικό Προσωπικό

Σύντομο Βιογραφικό

Η Δρ. Μερίκα έλαβε πτυχίο Βιολογίας από το Πανεπιστήμιο Αθηνών το 1983. Το 1985 έλαβε Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Εξειδίκευσης (ΜS) στον τομέα της Μοριακής Βιολογίας από το Πανεπιστήμιο Κρήτης. Η διατριβή της επί Διδακτορία (PhD) που διεξήχθη στο Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολογίας  (ΙΜΒΒ-ΙΤΕ), ολοκληρώθηκε το 1990 και αφορούσε στη δομή και ρύθμιση των γονιδίων της α-σφαιρίνης στον άνθρωπο.  Ακολούθησε εκτενής εκπαίδευση της ως Μεταδιδακτορικής υποτρόφου, υποστηριζόμενης από υποτροφία του Howard Hughes Medical Institute, στο Τμήμα Αιματολογίας/Ογκολογίας του Childrens Hospital, Harvard Medical School στη Βοστώνη, στο εργαστήριο του Καθ. Stuart Orkin.  Το θέμα της μεταδιδακτορικής της έρευνας ήταν η μελέτη των μηχανισμών μέσω των οποίων οι ερυθροειδείς μεταγραφικοί παράγοντες GATA και EKLF προσδένονται στις ρυθμιστικές τους DNA αλληλουχίες και ελέγχουν τη μεταγραφή στα ερυθροειδή κύτταρα.  Το 1995, συνέχισε τις μεταδιδακτορικές της σπουδές στο εργαστήριο του Δρ. Δημήτρη Θάνου στο Πανεπιστήμιο Columbia της Ν. Υόρκης, στο τμήμα Βιοχημείας και Μοριακής Βιοφυσικής.  Το 1998 προήχθη σε Staff Research Scientist στο Πανεπιστήμιο Columbia, μελετώντας τους μηχανισμούς βάσει των οποίων το ενισχυόσωμα της IFN-β ενεργοποιεί τη μεταγραφή.  Η ερευνητική της εργασία έπαιξε σημαντικό ρόλο στη διελεύκανση των μηχανισμών της μεταγραφικής συνέργειας μεταξύ των μεταγραφικών παραγόντων που προσδένονται στον ενισχυτή της IFN-β.  Το 2001 εξελέγη Ειδικός Λειτουργικός Επιστήμονας Β’ βαθμίδας στο Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής του Ερευνητικού Κέντρου Βιοιατρικών Ερευνών «Αλ. Φλέμινγκ», στην Αθήνα.  Εκεί, έπαιξε καταλυτικό ρολο στην εγκαθίδρυση και λειτουργία του Ινστιτούτου Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής, και στη μελέτη του ρόλου της δομής της χρωματίνης στη ρύθμιση της μεταγραφής και της κυτταρικής διαφοροποίησης.  Από το 2006 έως σήμερα, κατέχει τη θέση Ειδικού Λειτουργικού Επιστήμονα Α’ βαθμίδας στον Τομέα Μοριακής Βιολογίας, Κέντρο Βασικής Έρευνας ΙΙ, στο Ίδρυμα Βιοιατρικών Ερευνών της Ακαδημίας Αθηνών.  Τα παρόντα ερευνητικά της ενδιαφέροντα εστιάζονται  στη κατανόηση των μοριακών μηχανισμών βάσει των οποίων οι ευκαρυωτικοί μεταγραφικοί παράγοντες επιλέγουν τις θέσεις πρόσδεσής τους στο γονιδίωμα, αλλά και το πώς ενεργοποιούν ή καταστέλλουν τη μεταγραφή παρακείμενων γονιδίων, χρησιμοποιώντας σαν μοντέλο την επαγόμενη από ιό μεταγραφική ενεργοποίηση του ανθρώπινου γονιδίου της IFN-β.

Επιλεγμένες Δημοσιεύσεις

Transcription factors mediate long-range enhancer-promoter interactions.
Nolis IK, McKay DJ, Mantouvalou E, Lomvardas S, Merika M, Thanos D.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Dec 1;106(48):20222-7. Epub 2009 Nov 18.

Bypassing the requirements for epigenetic modifications in gene transcription by increasing enhancer strength.
Koutroubas G, Merika M, Thanos D.
Mol Cell Biol. 2008 Feb;28(3):926-38. Epub 2007 Nov 19.

Coordination of a transcriptional switch by HMGI(Y) acetylation.
Munshi N, Agalioti T, Lomvardas S, Merika M, Chen G, Thanos D.
Science. 2001 Aug 10;293(5532):1133-6.

Enhanceosomes.
Merika M, Thanos D.
Curr Opin Genet Dev. 2001 Apr;11(2):205-8.

The IFN-beta enhancer: a paradigm for understanding activation and repression of inducible gene expression.
Munshi N, Yie Y, Merika M, Senger K, Lomvardas S, Agalioti T, Thanos D.
Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 1999;64:149-59.

Gene repression by coactivator repulsion.
Senger K, Merika M, Agalioti T, Yie J, Escalante CR, Chen G, Aggarwal AK, Thanos D.
Mol Cell. 2000 Oct;6(4):931-7.

Stimulus-specific assembly of enhancer complexes on the tumor necrosis factor alpha gene promoter.
Falvo JV, Uglialoro AM, Brinkman BM, Merika M, Parekh BS, Tsai EY, King HC, Morielli AD, Peralta EG, Maniatis T, Thanos D, Goldfeld AE.
Mol Cell Biol. 2000 Mar;20(6):2239-47.

The role of HMG I(Y) in the assembly and function of the IFN-beta enhanceosome.
Yie J, Merika M, Munshi N, Chen G, Thanos D.
EMBO J. 1999 Jun 1;18(11):3074-89.

Acetylation of HMG I(Y) by CBP turns off IFN beta expression by disrupting the enhanceosome.
Munshi N, Merika M, Yie J, Senger K, Chen G, Thanos D.
Mol Cell. 1998 Oct;2(4):457-67.

Recruitment of CBP/p300 by the IFN beta enhanceosome is required for synergistic activation of transcription.
Merika M, Williams AJ, Chen G, Collins T, Thanos D.
Mol Cell. 1998 Jan;1(2):277-87.

Functional synergy and physical interactions of the erythroid transcription factor GATA-1 with the Krüppel family proteins Sp1 and EKLF.
Merika M, Orkin SH.
Mol Cell Biol. 1995 May;15(5):2437-47.

DNA-binding specificity of GATA family transcription factors.
Merika M, Orkin SH.
Mol Cell Biol. 1993 Jul;13(7):3999-4010.

PubMed:

PubMed Link